An einer Reihe von kleineren deutschen Airports war die Fluggesellschaft der größte Kunde und sorgte für ihre Anbindung an die wichtigsten touristischen Ziele. Besonders stark wird der Flughafen Erfurt/Weimar in Mitleidenschaft gezogen. Er verliert mit Germania seinen mit Abstand größten Kunden, der 2018 mit 185.000 Fluggästen 70 Prozent aller Passagiere flog. Nun steuern den Airport in Thüringen nur noch Corendon und Fly Egypt an. Ebenfalls arg gebeutelt wird der Flughafen Rostock-Laage. Dort machten die 136.000 Reisenden, die Germania im vergangenen Jahr beförderte, laut lokalen Medien 46 Prozent der gesamten Fluggastzahl aus.